Die nested (verschachtelte) PCR
Bei der nested PCR wird nach erfolgreicher erster Amplifikation das erste PCR-Produkt als Template für eine zweite PCR verwendet.
Die nested PCR ist eine Methode, um die Spezifität der PCR weiter zu erhöhen. Hierbei wird in einem ersten Schritt die PCR mit einem Template über wenige Zyklen durchgeführt. Anschließend werden in einer zweiten Runde neue Primer eingesetzt. Die neuen Primer liegen weiter innen als die ersten, so dass in diesem zweiten Schritt nur noch die spezifischen DNA Abschnitte des ersten Schritts amplifiziert werden. Es kann auch nur ein weiter innen liegender Primer eingesetzt werden. Dies erhöht die Empfindlichkeit und die Effizienz so enorm, dass sehr sorgfältig und kontaminationsfrei gearbeitet werden muss, da Verunreinigungen ungewünschte Auswirkungen haben können.
