In der Praxis wird vor den drei sich immer wiederholenden Schritten eine einmalig verlängerte Denaturierung
durchgeführt. Für das Aufbrechen der nativen räumlichen Strukturen der Template-DNA muss beim ersten Mal mehr Energie als sonst aufgebracht werden. Ferner hat
sich gezeigt, dass ein abschließender, zeitlich erweiterter Primer-Verlängerungsschritt zu einer erhöhten Ausbeute führt. Nach Beendigung dieses letzten
Schrittes werden die Proben bis zur Entnahme auf 4
Durchführung der PCR
Einmalige Denaturierung: Verbessertes Aufschmelzen zu Beginn des Zyklus (30
Denaturierung: Aufschmelzen der DNA, des so genannten Templates.
Primer-Annealing: Anlagerung der Primer an das Template.
Primer-Extension: Verlängerung der Primer.
Einmalige, lange Primer-Extension zum Auffüllen eventuell verbliebener kurzer Fragmente (7 min bei 72
Lagerung der Proben (bei 4