Unter chemischen Komponenten versteht man alle Additive des Reaktionsgemisches und alle Reaktionsprodukte außer den Polymeren. Eine zentrale Rolle spielt das Magnesium, das als zweiwertiges Kation nicht nur die negativen Ladungen des Phosphat-Rückgrats der DNA absättigt, sondern auch eine wesentliche Rolle bei der Stabilisierung der Konformation der einzelnen Nucleotidtriphosphate spielt. Die Nebenprodukte der Polymerisation dürfen keinesfalls vernachlässigt werden, weil sie unter Umständen die Rückreaktion initiieren können.
