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Proteinmodellierung (Helix)

Präferenz Faltblatt

Tab.1
Indices für die Zuordnung Faltblatt
NameSymbolLadungP-WertBereich
ValVohne1,70 Hβ
IleIohne1,60 Hβ
TyrYohne1,47 Hβ
PheFohne1,38 hβ
TrpWohne1,37 hβ
LeuLohne1,30 hβ
CysCohne1,19 hβ
ThrTohne1,19 hβ
GlnQohne1,10 hβ
MetMohne1,05 hβ
ArgRpositiv0,93 iβ
AsnNohne0,89 iβ
HisHpositiv0,87 iβ
AlaAohne0,83 iβ
SerSohne0,75 bβ
GlyGohne0,75 bβ
LysKpositiv0,74 bβ
ProPohne0,55 Bβ
AspDnegativ0,54 Bβ
GluEnegativ0,37 Bβ

Indices für die Aufenthaltswahrscheinlichkeiten (P-Werte) für α-Helix und β-Faltblatt auf der Basis von 29 gelösten Röntgenstrukturanalysen. Entnommen aus: Chou & Fasman (1978).

Literatur

Chou, P. H.; Fasman, G. D. (1978): Prediction of the secondary structure of proteins from their amino acid sequence. In: Adv. Enzymology. 47 , 45-148

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