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Proteinmodellierung (Helix)

Präferenz Helix

Tab.1
Indices für die Zuordnung Helix
NameSymbolLadungP-WertBereich
GluEnegativ1,51 Hα
MetMohne1,45 Hα
AlaAohne1,42 Hα
LeuLohne1,21 Hα
LysKpositiv1,16 hα
PheFohne1,13 hα
GlnQohne1,11 hα
TrpWohne1,08 hα
IleIohne1,08 hα
ValVohne1,06 hα
AspDnegativ1,01 Iα
HisHpositiv1,00 Iα
ArgRpositiv0,98 iα
ThrTohne0,83 iα
SerSohne0,77 iα
CysCohne0,70 iα
TyrYohne0,69 bα
AsnNohne0,67 bα
ProPohne0,57 Bα
GlyGohne0,57 Bα

Indices für die Aufenthaltswahrscheinlichkeiten (P-Werte) für α-Helix und β-Faltblatt auf der Basis von 29 gelösten Röntgenstrukturanalysen. Entnommen aus: Chou & Fasman (1978).

Literatur

Chou, P. H.; Fasman, G. D. (1978): Prediction of the secondary structure of proteins from their amino acid sequence. In: Adv. Enzymology. 47 , 45-148

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