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Proteinmodellierung (Helix)

Auswertung der Online-Anfragen

1. Suche nach Proteinen mit ähnlicher Sequenz:

Abb.1
FASTA
Abb.2
BLAST

Die Aminosäure-Sequenz des Beispielproteins besitzt eine hohe Homologie zu verschiedenen bakteriellen Proteinen. Das Repressor-Protein C2 des Bakteriophagen P22 scheint ihm sehr nahe zu stehen. Da von diesem Protein auch die dreidimensionale Struktur bekannt ist, wurde es für das Alignment ausgewählt. Die Programmausgabe zeigt, dass das Beispiel N-terminal fast identisch mit dem Repressor-Protein C2 ist.

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