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Online Dienste

Tab.1
Homepages der Online-Dienste (13.05.2004)
KategorieLinkBeschreibung
Homologiesuche Fasta Lipman and Pearson (1988), Science 227, 1435-1441
Blast Altschul et al. (1990), J. Mol. Biol. 215, 403-410
Sequenzalignment Clustalw Higgins et al. (1996), Methods Enzymol. 266, 383-402
Primärstruktur Analyse ProtScale Sekundärstrukturberechnungen einer Proteinsequenz (u.a. Hydrophobizität, Chou-Fasman)
ProtParam Berechnet einige physikalisch-chemische Parameter sowie Halbwertszeit und Stabilitätsindices
MW, pI , Titration curve Berechnet pI, Aminosäurezusammensetzung und die Titrationskurve
Sekundärstrukturvorhersage nnPredict Sekundärstrukturvorhersage anhand der eingegebenen Sequenz (University of California, UCSF).
Tertiärstruktur PredictProtein komplette Analyse basierend auf PHD (neuronales Netzwerk) von Rost & Sanders (Columbia University )
Swiss-PdbViewer Programm zur Darstellung, Analyse und Schichtung von 3D-Proteinstrukturen
Charakterisierung AACompIdent Identifiziert Proteine anhand ihrer Aminosäurenzusammensetzung
AACompSim Vergleicht die AS-Zusammensetzung eines Protein eines SWISS-PROT-Eintrags mit allen anderen Eintragungen