Beim Abbau von Proteinen werden die Peptidbindungen durch Endo- und Exo-Peptidasen hydrolytisch gespalten. Sollen die
Aminosäuren weiter abgebaut werden, muss der Organismus die Freisetzung von Ammoniak (
Durch diesen Prozess können nicht-essentielle Aminosäuren für die Proteinbiosynthese oder zur Erzeugung biogener Amine gewonnen werden, oder es werden Asparaginsäure und Glutaminsäure gebildet, die in den Harnstoff-Cyclus eingeschleust werden. Im Harnstoff-Cyclus erfolgt dann die eigentliche Ammoniak-Entgiftung.