Proteinmodellierung (Helix)
Auswertung der Online-Anfragen
2. Berechnung von physikochemischen und biochemischen Parametern:
Das Beispielprotein besitzt eine molekulare Masse von 8.946,31
Die Summenformel des Proteins ist C383H652N116O123S3 , was einer Anzahl von 1.277 Atomen entspricht.
Der molare Extinktionskoeffizient (280 nm) beläuft sich auf 2.560 [mol-1 cm-1], und der berechnete isoelektrische Punkt liegt bei pH 10,2.
In einer E.coli-Zelle wird die Halbwertszeit des Proteins auf größer 10 Stunden geschätzt.
Zusammen mit einem Instabilitätsindex von 35 wird das Protein als stabil eingestuft.
Die relative Aminosäure-Zusammensetzung lautet:
- Tab.1
- Zusammensetzung des Proteins
| Aminosäure | Abk. | Anzahl | Anteil |
|---|---|---|---|
| Alanin | Ala (A) | 8 | 9,8% |
| Arginin | Arg (R) | 6 | 7,3% |
| Asparagin | Asn (N) | 6 | 7,3% |
| Asparaginsäure | Asp (D) | 2 | 2,4% |
| Cystein | Cys (C) | 1 | 1,2% |
| Glutamin | Gln, GlN (Q) | 4 | 4,9% |
| Glutaminsäure | Glu (E) | 5 | 6,1% |
| Glycin | Gly (G) | 5 | 6,1% |
| Histidin | His (H) | 0 | 0,0% |
| Isoleucin | Ile (I) | 3 | 3,7% |
| Leucin | Leu (L) | 12 | 14,6% |
| Lysin | Lys (K) | 6 | 7,3% |
| Methionin | Met (M) | 2 | 2,4% |
| Phenylalanin | Phe (F) | 0 | 0,0% |
| Prolin | Pro (P) | 3 | 3,7% |
| Serin | Ser (S) | 7 | 8,5% |
| Threonin | Thr (T) | 7 | 8,5% |
| Tryptophan | Trp (W) | 0 | 0,0% |
| Tyrosin | Tyr (Y) | 2 | 2,4% |
| Valin | Val (V) | 3 | 3,7% |
| Selenocystein | Sec (U) | 0 | 0,0% |
| Pyrrolysin | Pyl (O) | 0 | 0,0% |
| Asn oder Asp | Asx (B) | 0 | 0,0% |
| Gln oder Glu | Glx (Z) | 0 | 0,0% |
| unbekannt | Xaa (X) | 0 | 0,0% |
