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Tutorial MenueMolecular ModelingLerneinheit 3 von 18

Molekülmechanik - Nichtbindende Wechselwirkungen

Molekülmechanik: Wasserstoff-Brücken

Für polare Biomoleküle (Proteine, Nucleinsäuren) sind die zusätzlichen Parameter für Wasserstoff-Brückenbindungen wichtig.

Abb.1

Die potenzielle Energie wird beschrieben durch das "10-12-Potenzial", das z.B. im AMBER-Kraftfeld implementiert ist.

Cij und Dij sind die Parameter für die Wasserstoff-Brücken zwischen Atom i und Atom j (abhängig von den jeweiligen Atomtypen).

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